Protein–RNA interactions for Protein: J3KSC0

LINC01387, Putative uncharacterized protein encoded by LINC01387, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC01387J3KSC0 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 CDIPT-204ENST00000563415 1047 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 FBXW8-201ENST00000309909 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 STAC3-202ENST00000546246 1014 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 C17orf62-230ENST00000583617 866 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
LINC01387J3KSC0 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 AC027031.2-201ENST00000521369 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 WNT7B-204ENST00000410089 2202 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 NT5C1A-201ENST00000235628 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 UNC93B2-201ENST00000285383 730 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 B3GAT3-202ENST00000531383 2056 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 PPM1L-204ENST00000497343 1589 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 KLF14-201ENST00000583337 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LINC01387J3KSC0 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.9 ms