Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 ZNF274-212ENST00000617501 2538 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 TRAPPC5-204ENST00000596148 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 EFTUD1P1-204ENST00000560401 1798 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
CCER2I3L3R5 RBM24-202ENST00000379052 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
CCER2I3L3R5 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms