Protein–RNA interactions for Protein: A6NK58

LIPT2, Putative lipoyltransferase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 231 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIPT2A6NK58 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 TBC1D9-201ENST00000442267 5306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 LRRC14-201ENST00000292524 5328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 SRCIN1-213ENST00000617146 7058 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 RAC1-202ENST00000356142 907 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 EML6-201ENST00000356458 8320 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
LIPT2A6NK58 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.7 ms