Protein–RNA interactions for Protein: A6NFI3

ZNF316, Zinc finger protein 316, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,004 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF316A6NFI3 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 TFCP2-204ENST00000548115 1862 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 NRBP1-203ENST00000379852 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZNF316A6NFI3 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 AP2M1-203ENST00000411763 1577 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 BX890604.1-207ENST00000486571 904 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 HES2-206ENST00000489730 730 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 DBNDD2-206ENST00000372720 1481 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 AC013269.1-201ENST00000409259 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 TISP43-206ENST00000623376 1653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 SLC35A2-212ENST00000634665 486 ntTSL 4 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNF316A6NFI3 KCNK17-201ENST00000373231 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.1 ms