Protein–RNA interactions for Protein: A4D1N5

Putative uncharacterized protein FLJ40288, humanhuman

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A4D1N5 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 MARK3-204ENST00000416682 2969 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
A4D1N5 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 CCR7-201ENST00000246657 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 NOXO1-202ENST00000356120 1539 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
A4D1N5 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 AC116050.2-201ENST00000612102 1779 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 TESC-201ENST00000335209 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
A4D1N5 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
A4D1N5 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
A4D1N5 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
A4D1N5 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
A4D1N5 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
A4D1N5 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
A4D1N5 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
A4D1N5 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
A4D1N5 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.32
A4D1N5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC13.02□□□□□ -0.32
A4D1N5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
A4D1N5 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
A4D1N5 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
A4D1N5 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.6 ms