Protein–RNA interactions for Protein: A4D0S4

LAMB4, Laminin subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,761 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMB4A4D0S4 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 BEST2-201ENST00000042931 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 GRINA-201ENST00000313269 1968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 ACAP3-201ENST00000353662 2280 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 DMPK-203ENST00000354227 1982 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 ACOT2-204ENST00000613168 1553 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 Z82202.1-201ENST00000623446 1880 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
LAMB4A4D0S4 TMEM243-203ENST00000433078 1273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms