Protein–RNA interactions for Protein: A2A2Y4

FRMD3, FERM domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD3A2A2Y4 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 TXNRD3-205ENST00000640797 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 HP1BP3-202ENST00000375000 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 OTOP2-201ENST00000331427 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 FDX2-207ENST00000494368 584 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 PRELID3A-201ENST00000336990 1715 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
FRMD3A2A2Y4 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms