Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYL6

RPL17-C18orf32, Protein RPL17-C18orf32, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 BCL11A-209ENST00000489516 1508 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 EMBP1-201ENST00000458200 901 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PNKP-214ENST00000600573 1602 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AL031008.1-201ENST00000619963 541 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FAM212B-203ENST00000444059 1423 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 KMT5B-204ENST00000402185 1881 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PML-204ENST00000359928 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 LINC01237-203ENST00000430555 843 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms