Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ66

KRTAP4-12, Keratin-associated protein 4-12, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP4-12Q9BQ66 CTNND1-229ENST00000531014 5053 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC009078.3-201ENST00000624205 4084 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 HK3-201ENST00000292432 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PRKAB2-201ENST00000254101 5417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 UIMC1-212ENST00000511320 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC36A2-201ENST00000335244 3421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM6-202ENST00000380097 3403 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP3K9-205ENST00000554752 11169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 EDAR-203ENST00000409271 4323 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 HLCS-207ENST00000612277 6112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MYBPC3-201ENST00000256993 4217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MYBPC3-202ENST00000399249 4217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RAB44-202ENST00000612677 4233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF568-202ENST00000415168 3774 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RAD51D-202ENST00000345365 9988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIM26-267ENST00000453195 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 IFFO1-206ENST00000465801 2850 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RDH16-202ENST00000398138 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 LOXL4-201ENST00000260702 3653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MECOM-201ENST00000264674 4900 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MAN1B1-202ENST00000371589 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PLEKHA2-207ENST00000616834 3594 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TSC22D1-203ENST00000458659 4820 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF473-205ENST00000595661 4828 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC19A3-201ENST00000258403 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ABL2-206ENST00000504405 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RAMP2-AS1-205ENST00000592670 3118 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DPY19L2P2-204ENST00000438364 3947 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 KATNB1-201ENST00000379661 2664 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC018521.1-202ENST00000641877 2655 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM118A-201ENST00000216214 3458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RRM2B-211ENST00000621845 3483 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC27A4-201ENST00000300456 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 LINC01902-202ENST00000636983 4607 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MEF2A-205ENST00000557942 5413 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 BCLAF1-213ENST00000530767 4186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC073578.3-201ENST00000624926 4191 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DMTN-201ENST00000265800 2554 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF749-201ENST00000334181 2587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TPCN1-202ENST00000392569 2558 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SLC6A7-201ENST00000230671 3739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PLOD1-201ENST00000196061 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM156B-203ENST00000593751 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM156A-201ENST00000596733 2942 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 IL18BP-209ENST00000497194 4080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 KAT7-203ENST00000435742 3638 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 KCNA2-203ENST00000485317 2496 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CSNK1G1-207ENST00000634654 2485 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC118758.2-201ENST00000614242 2813 ntBASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 NDUFV3-201ENST00000340344 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SULF1-203ENST00000419716 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SENP1-201ENST00000448372 4679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MAPK1-201ENST00000215832 11022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TBC1D31-214ENST00000522420 3167 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CLTCL1-210ENST00000617926 1695 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TRMT10A-203ENST00000394877 3516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 NCOA4-204ENST00000581486 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AL035696.1-201ENST00000381078 2007 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SATB1-204ENST00000417717 4589 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AHCY-205ENST00000538132 2366 ntTSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DCAF4-213ENST00000555042 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC2.41□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 CLTC-202ENST00000393043 5292 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 OR10H5-202ENST00000642092 7044 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MAP4K4-203ENST00000347699 3792 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 MOV10L1-205ENST00000395858 3763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RSPH3-202ENST00000367069 6561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FAM129A-201ENST00000367511 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ANPEP-201ENST00000300060 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 ZNF543-201ENST00000321545 3659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 IGSF9-202ENST00000368094 4044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SUPT7L-203ENST00000405491 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TTC30B-201ENST00000408939 4017 ntAPPRIS P1 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AL080251.1-201ENST00000494072 4369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 SNHG14-215ENST00000551631 4008 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FXR1-202ENST00000357559 8711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 HSPB7-201ENST00000311890 2892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 BAIAP2-202ENST00000321300 2879 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 NUP62-201ENST00000352066 2870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC113554.2-201ENST00000577647 4862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AL355388.2-201ENST00000610146 2157 ntTSL 4 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 RAB37-201ENST00000340415 3804 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC106038.1-201ENST00000501194 3473 ntTSL 1 (best) BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 AC004014.2-201ENST00000623718 5122 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 DGKZP1-201ENST00000378718 2776 ntBASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 TRIO-201ENST00000344135 4065 ntTSL 2 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 NEDD9-216ENST00000620854 4086 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
KRTAP4-12Q9BQ66 FOXP2-220ENST00000634411 4065 ntTSL 5 BASIC2.4□□□□□ -2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 203.2 ms