Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 PITRM1-AS1-201ENST00000430356 3998 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 ST3GAL1-201ENST00000399640 6764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATAD2B-201ENST00000238789 8103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 FLG-AS1-205ENST00000445097 2857 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 PRDM15-203ENST00000422911 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 BTBD7-202ENST00000334746 8430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAB3GAP1-201ENST00000264158 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RTN3-206ENST00000377819 4937 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 NCAPH-201ENST00000240423 2763 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC02159-202ENST00000518580 2323 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL133467.3-203ENST00000461160 3574 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 UFM1-201ENST00000239878 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 LIMS1-203ENST00000393310 4392 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 IL18RAP-202ENST00000409369 1890 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL358473.1-202ENST00000458003 3496 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 CXCR6-202ENST00000438735 2242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC126773.4-201ENST00000612545 3043 ntBASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 GTF3C1-202ENST00000561623 7015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 TPD52-204ENST00000517427 2596 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 ECT2-201ENST00000232458 4087 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01537-201ENST00000450804 2450 ntTSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF415-213ENST00000597503 2469 ntTSL 2 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 MPZL3-201ENST00000278949 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 TNXB-201ENST00000375244 13132 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.43□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 MECP2-201ENST00000303391 10505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 ACVR2B-201ENST00000352511 11821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 ALDH1L2-201ENST00000258494 7547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADD2-201ENST00000264436 9267 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 SETD5-203ENST00000402198 6827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 BMPR1APS1-201ENST00000403332 1598 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 ALPK1-203ENST00000458497 5410 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 TLR10-206ENST00000508334 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 ANGPT2-203ENST00000523120 2997 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 EEA1-201ENST00000322349 9875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 IL1RL1-203ENST00000404917 3571 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 SRGAP2B-204ENST00000612199 7120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 CACNB2-205ENST00000377319 3116 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF814-201ENST00000435989 3146 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 OR5V1-217ENST00000641768 2763 ntAPPRIS P1 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 NCEH1-206ENST00000543711 4062 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATXN1-202ENST00000436367 10587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTPRD-204ENST00000397606 5038 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTPRD-211ENST00000486161 5039 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 C4orf46-202ENST00000508457 3358 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC01504-201ENST00000436054 2078 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RBM27-201ENST00000265271 6451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC006145.1-201ENST00000439234 2651 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 BACE1-202ENST00000392937 5155 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 HUWE1-202ENST00000262854 14739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 LIMCH1-208ENST00000508501 5054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 LIMCH1-217ENST00000512946 5057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 CNOT4-202ENST00000356162 2594 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 DDX24-211ENST00000640432 2580 ntTSL 5 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 NXF2B-205ENST00000618881 3193 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC067968.1-201ENST00000591793 3766 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 MATR3-232ENST00000502929 4373 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 MAPK10-281ENST00000641170 3070 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC26A5-208ENST00000393730 2498 ntTSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 MSN-201ENST00000360270 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 GCSAM-201ENST00000308910 3336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 PARP2-201ENST00000250416 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 COX6B1P3-201ENST00000312310 260 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.4-201ENST00000362333 112 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.25-201ENST00000362528 102 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU1-5P-201ENST00000362684 144 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.98-201ENST00000363109 102 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.114-201ENST00000363265 113 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-1339P-201ENST00000363574 91 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-1059P-201ENST00000363752 98 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RN7SKP15-201ENST00000364742 309 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-578P-201ENST00000390980 103 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC005042.1-201ENST00000393397 800 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPL24P7-201ENST00000399435 453 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5SP345-201ENST00000410646 108 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC239803.1-203ENST00000411978 452 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPA2P2-201ENST00000419698 796 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS3P2-201ENST00000421346 701 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 EEF1GP7-201ENST00000422983 703 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM246-AS1-202ENST00000425734 466 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 HNRNPA3P4-201ENST00000427514 803 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC244035.3-201ENST00000428399 271 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC097527.1-201ENST00000437031 530 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 SIRPG-AS1-201ENST00000437384 410 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 SNRPEP7-201ENST00000438350 220 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPL23AP89-201ENST00000439324 255 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 EIF5AP4-201ENST00000441206 465 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL161636.2-201ENST00000445179 927 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 GAPDHP14-201ENST00000450472 937 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 IMMP2L-205ENST00000450877 761 ntTSL 2 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPL7AP71-201ENST00000451120 739 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC31A1P1-201ENST00000451221 567 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC016724.1-201ENST00000453215 421 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL122008.1-201ENST00000456078 452 ntTSL 3 BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 FRMD7-203ENST00000464296 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPL7L1P8-201ENST00000469911 741 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL136126.1-201ENST00000473603 402 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 Y_RNA.654-201ENST00000497848 106 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC008885.1-201ENST00000514930 301 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNU6-150P-201ENST00000516237 95 ntBASIC3.42□□□□□ -1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.7 ms