Protein–RNA interactions for Protein: Q16787

LAMA3, Laminin subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 3,333 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA3Q16787 PANK1-202ENST00000322191 2513 ntTSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 HEATR1-203ENST00000366582 8447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 ZNF26-201ENST00000328654 17601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AL139240.1-201ENST00000422963 505 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 BX119904.1-201ENST00000432026 348 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 KRTAP19-11P-201ENST00000439851 104 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC005150.1-201ENST00000512831 628 ntTSL 2 BASIC3.53□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 SNHG1-217ENST00000541578 588 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 SNHG1-218ENST00000541615 748 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC141273.1-201ENST00000565300 479 ntTSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 UBL5P2-201ENST00000583788 219 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC097717.1-230ENST00000597051 738 ntTSL 3 BASIC3.53□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC128687.2-201ENST00000609657 566 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 BNIP3P41-202ENST00000616656 861 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 AC243829.7-201ENST00000633081 225 ntBASIC3.53□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 ZNF383-201ENST00000352998 6760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.53□□□□□ -1.84
LAMA3Q16787 UBE2D3-233ENST00000618836 3472 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.53□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 OR2L5-201ENST00000355281 2429 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 RAP1BP1-201ENST00000412709 553 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 LINC00428-201ENST00000415620 227 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 SSBP1-211ENST00000484178 676 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 LINC02131-201ENST00000563289 419 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC004832.5-201ENST00000608677 401 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 OR6R2P-201ENST00000609216 300 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 PRG4-202ENST00000367483 4921 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 PRG4-206ENST00000635041 4915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 ADCY10-201ENST00000367848 5055 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 CABS1-201ENST00000273936 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AL034376.1-201ENST00000380106 484 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 VN1R8P-201ENST00000407739 893 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 KCTD9P3-201ENST00000434597 1169 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AL591473.1-201ENST00000464297 313 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 SATB1-216ENST00000491519 1000 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 SLC25A46-208ENST00000513807 1546 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 FMN2-207ENST00000545751 1913 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AL359232.1-201ENST00000556361 442 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC110079.2-201ENST00000629462 1512 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC021078.1-201ENST00000499521 8636 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 UNC5C-205ENST00000610318 9403 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 CEP192-201ENST00000325971 7764 ntTSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 OR9H1P-201ENST00000446393 4888 ntAPPRIS P1 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC024940.1-203ENST00000398963 4423 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 GOLPH3L-201ENST00000271732 2999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC104623.2-202ENST00000623477 4002 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 LINC00484-204ENST00000439438 454 ntTSL 3 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC098824.1-201ENST00000453565 980 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 RN7SL20P-201ENST00000488827 297 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 KCTD9P6-201ENST00000522306 950 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AL139174.1-201ENST00000531489 886 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC234778.2-201ENST00000566241 354 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AL162574.2-201ENST00000614618 657 ntBASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 KIF23-206ENST00000558585 2296 ntTSL 2 BASIC3.52□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC027287.1-201ENST00000553115 1453 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 BLM-208ENST00000560509 3966 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AL365356.1-201ENST00000411512 736 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 LIMS1-AS1-201ENST00000411710 477 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 RDM1-219ENST00000615378 542 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 SCAF11-212ENST00000549162 3934 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 CDKL3-210ENST00000523832 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 EEF1A1P37-201ENST00000522748 715 ntBASIC3.51□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 SKP1-210ENST00000522855 802 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 LINC01146-208ENST00000557355 548 ntTSL 4 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC018371.1-201ENST00000584560 640 ntTSL 3 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 MYNN-203ENST00000544106 4815 ntTSL 1 (best) BASIC3.51□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 OR11H4-202ENST00000641082 1585 ntAPPRIS P1 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 GEN1-202ENST00000381254 6367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 CENPE-201ENST00000265148 8612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.51□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 RNU6ATAC15P-201ENST00000408279 121 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC034195.1-201ENST00000420000 559 ntTSL 4 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC091133.1-201ENST00000435491 483 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 RN7SL585P-201ENST00000470538 280 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AP006245.1-201ENST00000522549 120 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC008489.1-201ENST00000524271 483 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 OR10AG1-202ENST00000641071 2807 ntAPPRIS P1 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 RTN4-209ENST00000405240 4061 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 ESRRG-202ENST00000360012 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 UBE3A-202ENST00000397954 2873 ntTSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 PTPN13-201ENST00000316707 7546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 LINC00279-201ENST00000413486 473 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 MRPL50P2-201ENST00000416821 482 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC019097.1-201ENST00000424783 735 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 RPL21P40-201ENST00000428586 483 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 HSPE1P6-201ENST00000479457 291 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 RN7SKP244-201ENST00000516513 307 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC098826.3-201ENST00000603823 466 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 CR383658.2-201ENST00000547576 1525 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 ORC3-202ENST00000392844 2512 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 UBE3AP2-201ENST00000429033 2259 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC010168.2-201ENST00000562691 5428 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 SPART-201ENST00000355182 4820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 NDUFA5-207ENST00000471770 5608 ntTSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 PNLIPRP3-201ENST00000369230 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.5□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 POLR1D-202ENST00000399696 668 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AL161725.2-201ENST00000442442 403 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 AC068196.1-201ENST00000456895 833 ntTSL 3 BASIC3.5□□□□□ -1.85
LAMA3Q16787 HMGB3P13-201ENST00000511263 607 ntBASIC3.5□□□□□ -1.85
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