Protein–RNA interactions for Protein: Q12778

FOXO1, Forkhead box protein O1, humanhuman

Predictions only

Length 655 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXO1Q12778 AC104793.1-201ENST00000508189 2840 ntTSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 C12orf50-203ENST00000550553 1525 ntTSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 NCOA3-201ENST00000371997 6750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 SMC2-203ENST00000374793 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 ATRX-201ENST00000373344 11220 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 MOCS2-203ENST00000450852 1337 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 ZNF542P-204ENST00000482727 1305 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 DDX4-204ENST00000505374 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 CPNE8-202ENST00000360449 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 SAMD12-202ENST00000409003 8866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 MARCH1-202ENST00000339875 2476 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 TRGC1-201ENST00000443402 2730 ntAPPRIS P1 BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 EEF1A1P36-201ENST00000427807 1351 ntBASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 SLC1A3-202ENST00000381918 3652 ntTSL 1 (best) BASIC4.65□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 ERVFRD-3-201ENST00000578561 1617 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC015813.6-201ENST00000624409 5808 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 MAPK10-236ENST00000638313 3971 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 RIF1-203ENST00000428287 7722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 OR8J3-204ENST00000642058 3806 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 SRRM1-202ENST00000374389 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 ZNF569-203ENST00000392150 1918 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 ZNF808-201ENST00000359798 3600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 LRRC53-201ENST00000294635 3859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 SULF1-204ENST00000458141 5551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 CLCA3P-202ENST00000466454 3412 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 RXFP1-206ENST00000460056 2735 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 FAM196B-201ENST00000377365 2999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 CSMD3-201ENST00000297405 13212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 BDNF-AS-202ENST00000499568 2039 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 TET2-203ENST00000380013 9679 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC103591.2-201ENST00000265259 766 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 OR6C76-201ENST00000328314 939 ntAPPRIS P1 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 RNU6-374P-201ENST00000364146 108 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 DFNB59-201ENST00000375129 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AL590084.2-201ENST00000401481 382 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 LINC01359-201ENST00000415842 1157 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC098592.1-201ENST00000419352 333 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 RPS12P23-201ENST00000419579 400 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC009238.2-201ENST00000431026 355 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 STXBP5-AS1-204ENST00000431143 644 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 BX323845.1-201ENST00000432417 179 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 CKS1BP5-201ENST00000434172 273 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AL138767.2-201ENST00000446794 168 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC016751.2-201ENST00000453206 280 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 RPL7P22-201ENST00000466005 733 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC107027.1-201ENST00000503006 575 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 LINC02161-201ENST00000503691 420 ntTSL 3 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 ATP1B1P1-201ENST00000509767 915 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 HIGD1AP3-201ENST00000515857 278 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AP001574.1-201ENST00000519566 546 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 LINC00871-201ENST00000555246 408 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AL133485.1-201ENST00000555966 392 ntTSL 2 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC002400.1-201ENST00000569310 726 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 MIR5186-201ENST00000577504 120 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AP001180.3-201ENST00000582221 145 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 MAGOH2P-202ENST00000584384 429 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 MIR7515HG-239ENST00000591053 1113 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 BNIP3P24-201ENST00000593398 557 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 Mico1.1-201ENST00000611698 204 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC044839.1-205ENST00000614989 542 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AL353662.3-201ENST00000625131 237 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 LINC01232-203ENST00000625369 576 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 VPS50-202ENST00000305866 3613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 DNAH7-202ENST00000409063 1845 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 TRAT1-202ENST00000426646 1596 ntTSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 FAM69A-202ENST00000613047 2646 ntTSL 4 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 DOCK9-207ENST00000442173 7643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 ADAM18-201ENST00000265707 2388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 GDI2P1-201ENST00000429312 1336 ntBASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 MAPK10-235ENST00000638225 8941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 CPB2-202ENST00000439329 1655 ntTSL 5 BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AFTPH-204ENST00000409933 2811 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.64□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 CASC19-201ENST00000500112 5735 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 STAG2-203ENST00000371145 4393 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 INPP4B-220ENST00000513000 8831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 GPR18-202ENST00000397470 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 FANCI-201ENST00000300027 4713 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 PCDH9-203ENST00000456367 5072 ntTSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 CLCA3P-201ENST00000284054 2407 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 ZNF734P-201ENST00000419494 1534 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 MRPL35-202ENST00000337109 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 TANK-205ENST00000405852 2155 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 LRRC3B-205ENST00000456208 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 FMN1-202ENST00000334528 12355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 PCDH15-206ENST00000373965 9237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 PPP1R42-201ENST00000324682 1084 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 OR5W2-201ENST00000344514 933 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 Y_RNA.169-201ENST00000363745 96 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 RNU6-931P-201ENST00000363850 107 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 RNA5SP428-201ENST00000365129 132 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 SNORD82-201ENST00000365530 70 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 OR1L6-202ENST00000373684 1044 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 MIR124-3-201ENST00000384866 87 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 TRAV16-201ENST00000390444 329 ntAPPRIS P1 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 ATP5F1P4-201ENST00000397288 746 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 HIGD1C-201ENST00000398455 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 Z85994.1-201ENST00000406912 606 ntTSL 2 BASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 RPL37P18-201ENST00000411602 243 ntBASIC4.63□□□□□ -1.67
FOXO1Q12778 AC093157.1-203ENST00000416329 713 ntTSL 5 BASIC4.63□□□□□ -1.67
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