Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 COL6A6-201ENST00000358511 9581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC092329.3-201ENST00000611392 1904 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 NUP43-201ENST00000340413 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC093311.1-201ENST00000506586 2021 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 BBS12-203ENST00000542236 3431 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 AL109809.4-201ENST00000603520 2185 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 FSTL5-203ENST00000427802 2920 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 DOCK11-201ENST00000276202 6625 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC131649.2-201ENST00000624925 4439 ntBASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 LPAR1-202ENST00000374430 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 MTF1-201ENST00000373036 7972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 CAST-234ENST00000511049 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 PRDM2-203ENST00000343137 5797 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 TCAM1P-205ENST00000478379 3317 ntTSL 1 (best) BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 OR5A2-202ENST00000641361 6655 ntAPPRIS P1 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 MAGEB16-203ENST00000399988 1682 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.22□□□□□ -0.77
TRHP20396 VTCN1-202ENST00000359008 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRHP20396 BCO2-203ENST00000438022 2598 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRHP20396 BPIFC-204ENST00000534972 1809 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRHP20396 IL1R1-204ENST00000409929 1858 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRHP20396 ITPK1-AS1-201ENST00000553639 4701 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TRHP20396 TXNIP-204ENST00000582401 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRHP20396 TEX14-201ENST00000240361 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRHP20396 STOM-201ENST00000286713 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRHP20396 FAM186A-201ENST00000327337 7127 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRHP20396 LRRC4C-202ENST00000527150 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TRHP20396 HEPACAM2-201ENST00000341723 2122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRHP20396 HIVEP3-202ENST00000372584 12319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRHP20396 IPO9-201ENST00000361565 11435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRHP20396 Y_RNA.183-201ENST00000363882 113 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TRHP20396 SNORA51.11-201ENST00000384442 131 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TRHP20396 SNORA53-201ENST00000391141 249 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TRHP20396 AL583834.1-201ENST00000406943 343 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TRHP20396 BX323845.3-201ENST00000428215 527 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TRHP20396 MED13P1-201ENST00000428342 171 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TRHP20396 LINC01372-201ENST00000430244 489 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC005160.1-201ENST00000432405 381 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRHP20396 AL031275.1-201ENST00000457405 418 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRHP20396 RPL23AP41-201ENST00000484754 458 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC026979.1-201ENST00000492525 396 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TRHP20396 TMEM251P1-201ENST00000503717 318 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TRHP20396 LINC02447-203ENST00000504402 292 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRHP20396 CYCSP22-201ENST00000517555 339 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC244502.3-201ENST00000555460 457 ntTSL 3 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRHP20396 PPIAL4F-202ENST00000581138 660 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRHP20396 PPIAL4E-201ENST00000581164 785 ntAPPRIS P1 BASIC10.21□□□□□ -0.77
TRHP20396 AC100827.5-201ENST00000615883 426 ntBASIC10.21□□□□□ -0.77
TRHP20396 HDAC1P2-201ENST00000453661 1398 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
TRHP20396 SLC3A1-206ENST00000409740 1418 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TRHP20396 SNHG14-226ENST00000640631 13074 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TRHP20396 NQO1-201ENST00000320623 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TRHP20396 ZNF101P1-201ENST00000435701 1720 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
TRHP20396 NEK11-201ENST00000356918 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
TRHP20396 AC005538.2-201ENST00000623215 1864 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
TRHP20396 AL136981.1-203ENST00000451452 3844 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
TRHP20396 DCSTAMP-201ENST00000297581 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TRHP20396 PAK5-201ENST00000353224 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TRHP20396 LDB2-202ENST00000441778 2476 ntTSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
TRHP20396 MAPK10-329ENST00000641555 2656 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TRHP20396 RNF139-AS1-201ENST00000499418 5654 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRHP20396 RGS4-203ENST00000367909 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRHP20396 RAG1-201ENST00000299440 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRHP20396 AP003175.1-201ENST00000641383 6658 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TRHP20396 SLC12A6-201ENST00000290209 7286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRHP20396 VPS13A-202ENST00000357409 9967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRHP20396 RNA5SP205-201ENST00000364653 136 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TRHP20396 Y_RNA.398-201ENST00000383952 99 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TRHP20396 AC016027.5-201ENST00000427227 210 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TRHP20396 ZNF23-204ENST00000428724 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRHP20396 MIR4432HG-201ENST00000441598 470 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRHP20396 AP001439.1-201ENST00000455275 392 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRHP20396 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TRHP20396 RN7SL705P-201ENST00000481678 294 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TRHP20396 AC097486.1-201ENST00000515331 210 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TRHP20396 RSPO2-203ENST00000517939 2487 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRHP20396 ANKRD6-218ENST00000522441 3157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRHP20396 AC007991.1-201ENST00000522680 631 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TRHP20396 AC020910.3-201ENST00000603701 874 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TRHP20396 AP001486.3-201ENST00000615334 372 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TRHP20396 EDRF1-AS1-214ENST00000622798 526 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRHP20396 AC006600.2-201ENST00000624834 2506 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
TRHP20396 PCAT19-201ENST00000588495 3472 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRHP20396 SMARCA2-252ENST00000636559 6853 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRHP20396 DSCAM-203ENST00000617870 6176 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRHP20396 CHN2-208ENST00000412711 2991 ntTSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRHP20396 ZCCHC11-204ENST00000371544 5858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRHP20396 RND3-201ENST00000263895 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
TRHP20396 PZP-201ENST00000261336 4610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 PDZK1-202ENST00000417171 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 ECT2-216ENST00000540509 4406 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 LEO1-201ENST00000299601 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 LINC02097-201ENST00000419257 2063 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 COL6A5-201ENST00000265379 9214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 HSPA8P1-201ENST00000425843 1833 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 AC015849.5-201ENST00000604907 5473 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 NLRP9-201ENST00000332836 3484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 UBAP2L-220ENST00000613315 3451 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 MORC1-202ENST00000483760 3056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
TRHP20396 ANO6-201ENST00000320560 5975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.2 ms