Protein–RNA interactions for Protein: U3KPZ7

Uncharacterized protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,027 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
U3KPZ7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U3KPZ7 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
U3KPZ7 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
U3KPZ7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
U3KPZ7 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
U3KPZ7 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
U3KPZ7 AL512356.3-201ENST00000623005 461 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
U3KPZ7 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
U3KPZ7 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
U3KPZ7 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
U3KPZ7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KPZ7 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KPZ7 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KPZ7 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KPZ7 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KPZ7 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KPZ7 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KPZ7 PMCHL1-203ENST00000423301 697 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KPZ7 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KPZ7 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KPZ7 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KPZ7 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KPZ7 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KPZ7 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KPZ7 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KPZ7 AC090079.2-201ENST00000575289 768 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KPZ7 AC130324.1-201ENST00000584157 831 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KPZ7 AC008277.1-203ENST00000594921 1149 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KPZ7 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KPZ7 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KPZ7 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KPZ7 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KPZ7 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KPZ7 SNAPC2-201ENST00000221573 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KPZ7 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KPZ7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
U3KPZ7 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U3KPZ7 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U3KPZ7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U3KPZ7 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U3KPZ7 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
U3KPZ7 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U3KPZ7 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U3KPZ7 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U3KPZ7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U3KPZ7 HTRA4-201ENST00000302495 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U3KPZ7 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U3KPZ7 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U3KPZ7 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U3KPZ7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U3KPZ7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U3KPZ7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U3KPZ7 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U3KPZ7 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U3KPZ7 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
U3KPZ7 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
U3KPZ7 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
U3KPZ7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KPZ7 MEF2B-204ENST00000424583 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KPZ7 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KPZ7 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KPZ7 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KPZ7 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KPZ7 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KPZ7 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KPZ7 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KPZ7 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KPZ7 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KPZ7 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KPZ7 AL161909.2-201ENST00000417577 409 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KPZ7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KPZ7 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KPZ7 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KPZ7 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KPZ7 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KPZ7 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KPZ7 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KPZ7 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KPZ7 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KPZ7 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
U3KPZ7 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KPZ7 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KPZ7 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KPZ7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KPZ7 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KPZ7 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KPZ7 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KPZ7 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KPZ7 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KPZ7 COQ10B-203ENST00000409398 879 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KPZ7 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KPZ7 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KPZ7 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KPZ7 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KPZ7 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KPZ7 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KPZ7 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KPZ7 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KPZ7 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
U3KPZ7 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.5 ms