Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 LINC02317-201ENST00000555413 426 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 TRPM4-213ENST00000599628 1829 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
NCOA3Q9Y6Q9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 SMYD2-201ENST00000366957 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
NCOA3Q9Y6Q9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms