Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5X2

SNX8, Sorting nexin-8, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX8Q9Y5X2 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 DUT-202ENST00000455976 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 TYRO3-201ENST00000263798 8207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 RAMP1-202ENST00000403885 650 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 CASD1-201ENST00000297273 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 RHOT1-202ENST00000354266 2919 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 SLC1A7-201ENST00000371491 1306 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SNX8Q9Y5X2 DCAKD-205ENST00000588499 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms