Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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SNX13Q9Y5W8 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 FGF17-202ENST00000518533 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 SLC35F3-201ENST00000366617 2762 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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SNX13Q9Y5W8 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 ADRA1A-203ENST00000380572 1697 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
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SNX13Q9Y5W8 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 B3GALNT1-202ENST00000392779 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
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SNX13Q9Y5W8 TNFRSF14-201ENST00000355716 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
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SNX13Q9Y5W8 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 SMIM20-201ENST00000506197 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 MVB12A-212ENST00000543795 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 AC010536.3-201ENST00000620306 533 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 PPARG-202ENST00000309576 1870 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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SNX13Q9Y5W8 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
SNX13Q9Y5W8 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
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