Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y496

KIF3A, Kinesin-like protein KIF3A, humanhuman

Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KIF3AQ9Y496 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 AC133041.1-202ENST00000642053 222 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
KIF3AQ9Y496 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 ASPHD2-201ENST00000215906 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 ANAPC11-223ENST00000612413 964 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 PRKAR2A-206ENST00000454963 1849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 AC008443.1-203ENST00000505151 886 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 C12orf42-208ENST00000548883 1336 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KIF3AQ9Y496 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms