Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3F1

Putative TAP2-associated 6.5 kDa polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9Y3F1 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 PHACTR2-203ENST00000367584 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 FFAR1-201ENST00000246553 2311 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 WIPF2-202ENST00000394103 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 AL359747.1-201ENST00000442370 536 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 TANGO2-217ENST00000456048 2439 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 VAV3-202ENST00000370056 4990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 TMEM109-202ENST00000536171 1959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q9Y3F1 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8.2 ms