Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A6

TMED5, Transmembrane emp24 domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED5Q9Y3A6 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED5Q9Y3A6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED5Q9Y3A6 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED5Q9Y3A6 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED5Q9Y3A6 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
TMED5Q9Y3A6 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMED5Q9Y3A6 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMED5Q9Y3A6 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMED5Q9Y3A6 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMED5Q9Y3A6 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMED5Q9Y3A6 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMED5Q9Y3A6 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMED5Q9Y3A6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMED5Q9Y3A6 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
TMED5Q9Y3A6 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 RAB4A-205ENST00000618010 2799 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 HOXB2-201ENST00000330070 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 IGFBP3-211ENST00000615754 792 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 MCEMP1-201ENST00000333598 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 OSR2-202ENST00000435298 1736 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 C21orf91-203ENST00000400559 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 ABCC3-217ENST00000515707 656 ntTSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
TMED5Q9Y3A6 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms