Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y366

IFT52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT52Q9Y366 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT52Q9Y366 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT52Q9Y366 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IFT52Q9Y366 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFT52Q9Y366 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFT52Q9Y366 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IFT52Q9Y366 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 PYCR3-202ENST00000377579 985 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 ZNF582-207ENST00000619584 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 FDXR-217ENST00000582944 1766 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 AL359182.2-201ENST00000457720 606 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 TMEM191C-212ENST00000536718 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 AC006557.6-201ENST00000623071 864 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 RSAD1-201ENST00000258955 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 BABAM1-213ENST00000601043 1366 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
IFT52Q9Y366 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms