Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2V7

COG6, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 6, humanhuman

Predictions only

Length 657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COG6Q9Y2V7 HIC1-207ENST00000619757 6711 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 VEGFB-201ENST00000309422 1380 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 ZNF529-AS1-202ENST00000475219 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 AC069544.1-201ENST00000609399 999 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
COG6Q9Y2V7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 HOXD11-201ENST00000249504 1533 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 LINC00969-218ENST00000452844 583 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 LINC00969-221ENST00000457233 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 NDUFB10-204ENST00000569148 628 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
COG6Q9Y2V7 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms