Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2G9

SBNO2, Protein strawberry notch homolog 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SBNO2Q9Y2G9 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
SBNO2Q9Y2G9 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 HOXB8-201ENST00000239144 1823 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 KCNC2-204ENST00000540018 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 GOSR2-210ENST00000576910 1891 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 AC006001.3-204ENST00000638711 2103 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 ESR2-204ENST00000353772 2454 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SBNO2Q9Y2G9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.1 ms