Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y239

NOD1, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD1Q9Y239 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 CENPA-202ENST00000335756 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC21.32■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC21.32■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC21.31■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 DET1-201ENST00000268148 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC21.3■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 RIMBP3C-202ENST00000433039 5784 ntAPPRIS P2 BASIC21.3■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 TBC1D2B-202ENST00000409931 6086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
NOD1Q9Y239 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21 ms