Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNH6

SNX7, Sorting nexin-7, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX7Q9UNH6 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 LHX8-202ENST00000356261 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 KANK4-202ENST00000354381 2103 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 Z98884.1-201ENST00000451646 830 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 SLC6A6-208ENST00000621751 1252 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 BCS1L-201ENST00000359273 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 GAL3ST4-204ENST00000423751 1695 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 MRPS2-201ENST00000241600 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 DEDD2-204ENST00000595337 1894 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 ACVR1C-203ENST00000348328 1270 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 FAM26F-202ENST00000368605 1117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 MTFP1-206ENST00000629597 482 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 KRT78-201ENST00000304620 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 TXNL1-211ENST00000590954 1339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 B4GALT2-201ENST00000309519 2004 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
SNX7Q9UNH6 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.7 ms