Protein–RNA interactions for Protein: Q9UMY4

SNX12, Sorting nexin-12, humanhuman

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX12Q9UMY4 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 CASR-204ENST00000638421 5088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 BPTF-201ENST00000306378 9688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 HES2-205ENST00000487437 968 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 MCRIP1-203ENST00000538396 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 LINC01184-201ENST00000499346 1380 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 DNAJC11-201ENST00000294401 2210 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 NAA60-235ENST00000576916 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 MGST3-205ENST00000367889 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
SNX12Q9UMY4 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms