Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULD9

ZNF608, Zinc finger protein 608, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF608Q9ULD9 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 SMG1P5-201ENST00000411546 2362 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 RRAS-201ENST00000246792 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
ZNF608Q9ULD9 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 CPNE9-202ENST00000383831 1751 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 EMC8-202ENST00000435200 1935 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 NAP1L4-212ENST00000526115 1941 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 FP700111.2-201ENST00000619190 1892 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 SLC35A3-222ENST00000640715 1989 ntTSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC32.04■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 RGMA-208ENST00000556658 1889 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC32.03■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC32.01■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC32.01■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 LINC01558-202ENST00000495520 1652 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.72
ZNF608Q9ULD9 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ZNF608Q9ULD9 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
ZNF608Q9ULD9 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
ZNF608Q9ULD9 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.7 ms