Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKV0

HDAC9, Histone deacetylase 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,011 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC9Q9UKV0 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 HIGD1A-204ENST00000452906 585 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 KRT18P38-201ENST00000449496 1282 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 HYLS1-203ENST00000526028 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDAC9Q9UKV0 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC9Q9UKV0 DHRS4-201ENST00000313250 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms