Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ99

CDH22, Cadherin-22, humanhuman

Predictions only

Length 828 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH22Q9UJ99 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 GTF3C5-203ENST00000372099 1999 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 NUDT11-201ENST00000375992 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 DMRTB1-201ENST00000371445 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 VRK2-207ENST00000440705 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 C22orf39-206ENST00000611555 1977 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 KCTD1-202ENST00000408011 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 ABHD14B-208ENST00000525795 980 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 DBNDD1-201ENST00000002501 2079 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 WT1-212ENST00000640146 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 CENPA-201ENST00000233505 1299 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 SYT15-205ENST00000503753 1331 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 ME3-212ENST00000543262 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 CDIPT-202ENST00000561555 1726 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 GORAB-201ENST00000367762 1699 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 SERPINH1-212ENST00000530284 1358 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 FBXO31-207ENST00000618298 1871 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 LHX9-206ENST00000561173 2144 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 NDRG2-215ENST00000553503 2162 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 IRF7-205ENST00000397574 1968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 EPOR-201ENST00000222139 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CDH22Q9UJ99 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms