Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHD1

CHORDC1, Cysteine and histidine-rich domain-containing protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHORDC1Q9UHD1 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 REXO2-216ENST00000544196 452 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 SMTN-204ENST00000404574 1735 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 PFN3-201ENST00000358571 530 ntAPPRIS P1 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 KRT87P-201ENST00000529785 1700 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 KSR1-205ENST00000509603 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 SLC52A2-209ENST00000530047 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 DHRSX-201ENST00000334651 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 FBXL17-205ENST00000542267 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 SNX5-213ENST00000486039 602 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
CHORDC1Q9UHD1 RARRES2P10-201ENST00000564312 460 ntBASIC20.71■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 131.1 ms