Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBY8

CLN8, Protein CLN8, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLN8Q9UBY8 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 IRGQ-205ENST00000602269 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 DVL3-203ENST00000431765 2294 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 OGG1-204ENST00000339511 1815 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 ASMTL-206ENST00000534940 2048 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CLN8Q9UBY8 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 SYNGR4-202ENST00000595322 533 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 RBM14-RBM4-201ENST00000412278 1566 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 PIGQ-206ENST00000422307 2052 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 RTKN-201ENST00000233330 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 MOB3C-202ENST00000319928 2822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 GLB1-201ENST00000307363 2616 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 TRAPPC12-202ENST00000382110 2483 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 AC233702.5-201ENST00000584107 538 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 CLN8-208ENST00000635751 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 RNH1-203ENST00000397604 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 CCNO-201ENST00000282572 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 AC140479.4-201ENST00000561715 463 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
CLN8Q9UBY8 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms