Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBN7

HDAC6, Histone deacetylase 6, humanhuman

Predictions only

Length 1,215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC6Q9UBN7 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 DNASE1L2-203ENST00000564065 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 GTF2IRD2B-208ENST00000619142 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 AL035541.1-201ENST00000424850 823 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 TMEM230-207ENST00000379286 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 CSNK1D-203ENST00000392334 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 GOLGA6L3-201ENST00000507199 1679 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 MEN1-202ENST00000315422 3148 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 CFL2-205ENST00000555765 632 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 DXO-202ENST00000375349 1667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 LRCH4-211ENST00000619071 2098 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 POLE2-202ENST00000539565 1792 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 PHGDH-210ENST00000641115 1638 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 DENND6A-201ENST00000311128 4655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 NTN5-201ENST00000270235 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 MEF2D-203ENST00000368240 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 ARPP19-201ENST00000249822 5301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
HDAC6Q9UBN7 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 NRM-203ENST00000376421 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 KREMEN2-202ENST00000319500 1882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 HIC1-201ENST00000322941 3053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 PLBD1-201ENST00000240617 2426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 SMG8-203ENST00000578922 2178 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
HDAC6Q9UBN7 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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