Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZ52

GGA3, ADP-ribosylation factor-binding protein GGA3, humanhuman

Predictions only

Length 723 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GGA3Q9NZ52 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 TMED4-203ENST00000457408 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 CLDN14-202ENST00000399135 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 MTMR9LP-202ENST00000423995 1878 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 C1QL4-201ENST00000334221 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 GPR35-202ENST00000403859 2032 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 SHMT1-201ENST00000316694 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 SLC7A10-201ENST00000253188 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 FBXO27-207ENST00000600828 1557 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 FARP2-223ENST00000627550 2122 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 ABHD14A-ACY1-202ENST00000463937 1705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 AC011511.1-201ENST00000452032 1956 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 SLC39A4-202ENST00000301305 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 GYG1-202ENST00000345003 2052 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 SOCS2-206ENST00000549122 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GGA3Q9NZ52 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms