Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYG2

ZDHHC3, Palmitoyltransferase ZDHHC3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZDHHC3Q9NYG2 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 RPS15-203ENST00000586096 570 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 AC087482.1-204ENST00000636067 2431 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 AC005332.7-201ENST00000614046 2005 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 NAT6-204ENST00000443094 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 EFTUD1P1-201ENST00000558187 596 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 USP36-216ENST00000589424 970 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 ASMTL-202ENST00000381333 2035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 LINC00511-201ENST00000453722 1716 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 AL032819.2-201ENST00000624543 2162 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 GTF3A-201ENST00000381140 1383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 DNAL4-201ENST00000216068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 RELB-207ENST00000625761 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 RCCD1-201ENST00000394258 2689 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ZDHHC3Q9NYG2 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms