Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYB5

SLCO1C1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLCO1C1Q9NYB5 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 SCAMP3-201ENST00000302631 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 TSPAN14-203ENST00000372156 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 AC018553.1-201ENST00000616682 1458 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 ZDHHC24-203ENST00000526986 1424 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 FAM131C-201ENST00000375662 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 ZSWIM8-220ENST00000604524 5465 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
SLCO1C1Q9NYB5 MARK1-202ENST00000366918 5169 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 RAB11B-201ENST00000328024 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 GGT1-206ENST00000404223 952 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 AC018521.5-202ENST00000577279 374 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 AC018521.5-201ENST00000582787 496 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 C11orf86-201ENST00000308963 1187 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
SLCO1C1Q9NYB5 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms