Protein–RNA interactions for Protein: Q9NXJ0

MS4A12, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 12, humanhuman

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A12Q9NXJ0 ATP6V0B-213ENST00000532642 1685 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 CPEB1-214ENST00000617522 2220 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 RNASET2-214ENST00000620173 1391 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 LPAR2-202ENST00000542587 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 ACADVL-203ENST00000356839 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 TMSB4X-203ENST00000380636 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 AMDHD1-201ENST00000266736 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 SMC5-AS1-201ENST00000594708 1818 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 DLG3-202ENST00000374355 5074 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 GNB1-201ENST00000378609 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 NTMT1-209ENST00000611055 1562 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 CABP2-204ENST00000636477 941 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
MS4A12Q9NXJ0 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.9 ms