Protein–RNA interactions for Protein: Q9NX18

SDHAF2, Succinate dehydrogenase assembly factor 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDHAF2Q9NX18 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 FAM216A-201ENST00000377673 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 DOK2-201ENST00000276420 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 PCBP3-203ENST00000400308 1911 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 AC013268.1-206ENST00000638368 961 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 AC112229.1-201ENST00000639295 961 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 BLACE-201ENST00000378120 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 BACE1-209ENST00000513780 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 STK25-205ENST00000405883 1904 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 TNFRSF1A-201ENST00000162749 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 NMRAL1-213ENST00000574733 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 ZNRF2P2-202ENST00000442865 590 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 AC016405.3-201ENST00000607710 860 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 CD99-212ENST00000624481 1089 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 PDLIM5-205ENST00000380180 2020 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SDHAF2Q9NX18 H19-201ENST00000411754 1788 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SDHAF2Q9NX18 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SDHAF2Q9NX18 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SDHAF2Q9NX18 CPLX3-201ENST00000395018 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SDHAF2Q9NX18 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SDHAF2Q9NX18 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF2Q9NX18 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF2Q9NX18 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF2Q9NX18 ZNF534-201ENST00000301085 1525 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF2Q9NX18 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF2Q9NX18 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF2Q9NX18 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF2Q9NX18 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF2Q9NX18 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF2Q9NX18 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF2Q9NX18 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SDHAF2Q9NX18 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.3 ms