Protein–RNA interactions for Protein: Q9NTQ9

GJB4, Gap junction beta-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB4Q9NTQ9 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 B4GALT1-202ENST00000535206 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 RASD1-201ENST00000225688 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 SLC1A6-202ENST00000430939 1794 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 TSPY8-201ENST00000287721 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 TSPY10-201ENST00000428845 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 TSPY3-203ENST00000457222 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
GJB4Q9NTQ9 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 SBK1-201ENST00000341901 4992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 AC069544.2-201ENST00000640019 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 RBPJL-203ENST00000372743 1623 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 RORA-204ENST00000449337 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 BACE1-203ENST00000428381 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 MLF2-201ENST00000203630 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 OPA3-203ENST00000544371 1146 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 C6orf89-203ENST00000373685 1400 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 PEX16-210ENST00000532681 1639 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 ANHX-202ENST00000545940 3452 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
GJB4Q9NTQ9 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms