Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSP4

CENPM, Centromere protein M, humanhuman

Predictions only

Length 180 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPMQ9NSP4 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 LINC00304-202ENST00000562248 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 CHMP6-201ENST00000325167 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
CENPMQ9NSP4 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 MAGIX-202ENST00000595224 1238 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 SULT1A1-202ENST00000350842 1282 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 GNB5-211ENST00000560116 918 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 SLC27A3-214ENST00000624995 2413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 EIF2B1-201ENST00000424014 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 AL020996.1-203ENST00000536896 2307 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
CENPMQ9NSP4 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.3 ms