Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD5

SLC6A13, Sodium- and chloride-dependent GABA transporter 2, humanhuman

Predictions only

Length 602 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC6A13Q9NSD5 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 TH-203ENST00000352909 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 COA6-202ENST00000366613 641 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 AC006970.2-201ENST00000450065 779 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 PPP1R14BP3-201ENST00000509033 445 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 AC105020.4-201ENST00000569467 563 ntTSL 4 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 TSG101-201ENST00000251968 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 RPL7-202ENST00000396465 1308 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 GTF3C5-201ENST00000342018 1905 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 CHCHD10-201ENST00000401675 691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 AC090527.2-201ENST00000564080 1060 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 AP006587.1-201ENST00000534129 1502 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 CAMKMT-201ENST00000378494 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 IFI27L2-201ENST00000238609 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 TRNT1-207ENST00000420393 854 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 NCF1B-203ENST00000435988 1254 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 LRRC36-201ENST00000329956 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 CPT2-207ENST00000636867 2643 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 FMR1-207ENST00000439526 3699 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
SLC6A13Q9NSD5 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 XXYLT1-202ENST00000356740 564 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 YBX1P10-201ENST00000444752 975 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 SEC23A-AS1-201ENST00000557350 500 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 AC009065.4-203ENST00000562838 535 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
SLC6A13Q9NSD5 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms