Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 RNASET2-203ENST00000366855 1417 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCDHB16Q9NRJ7 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCDHB16Q9NRJ7 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCDHB16Q9NRJ7 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCDHB16Q9NRJ7 SNRPA-201ENST00000243563 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCDHB16Q9NRJ7 WDR45-207ENST00000376372 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
PCDHB16Q9NRJ7 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCDHB16Q9NRJ7 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCDHB16Q9NRJ7 ANKRD2-201ENST00000298808 1350 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCDHB16Q9NRJ7 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCDHB16Q9NRJ7 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCDHB16Q9NRJ7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCDHB16Q9NRJ7 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCDHB16Q9NRJ7 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCDHB16Q9NRJ7 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCDHB16Q9NRJ7 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCDHB16Q9NRJ7 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCDHB16Q9NRJ7 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCDHB16Q9NRJ7 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCDHB16Q9NRJ7 CCDC103-202ENST00000410006 921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCDHB16Q9NRJ7 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCDHB16Q9NRJ7 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCDHB16Q9NRJ7 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCDHB16Q9NRJ7 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCDHB16Q9NRJ7 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
PCDHB16Q9NRJ7 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 TBC1D10A-204ENST00000403477 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 SSBP2-218ENST00000514493 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 CRACR2B-207ENST00000528542 1792 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 KLHL31-202ENST00000407079 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 CYB561D2-205ENST00000425346 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 BRSK1-202ENST00000326848 2095 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 FBL-201ENST00000221801 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 RPH3AL-203ENST00000536489 1235 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 PTCD3-220ENST00000627371 210 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 RUNX1-207ENST00000437180 5967 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 RAB34-201ENST00000301043 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 RAB5C-202ENST00000393860 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 GRTP1-203ENST00000375431 1384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 ORAI3-204ENST00000566237 1393 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 SSH1-209ENST00000551165 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 LIMS2-204ENST00000409286 1678 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 CCDC71-201ENST00000321895 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 TSSC4-207ENST00000451491 1423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 EGFR-204ENST00000420316 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
PCDHB16Q9NRJ7 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms