Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ5

PAPOLB, Poly(A) polymerase beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPOLBQ9NRJ5 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 PRR16-201ENST00000379551 1826 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 SSR1-204ENST00000474597 1808 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 ST6GALNAC6-215ENST00000542456 2018 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 NEURL3-204ENST00000451794 1461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 SUGCT-202ENST00000401647 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 EIF2B1-204ENST00000537073 1768 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 C3orf33-201ENST00000340171 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 MEF2B-203ENST00000410050 1429 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 RALGPS1-204ENST00000373436 1667 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 SLC2A7-201ENST00000400906 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 AF213884.3-201ENST00000563833 479 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
PAPOLBQ9NRJ5 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms