Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR55

BATF3, Basic leucine zipper transcriptional factor ATF-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BATF3Q9NR55 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 GNE-204ENST00000539208 2190 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 APLP2-204ENST00000345598 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 GSDMD-212ENST00000533063 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 GABRD-205ENST00000638771 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 ST6GAL2-203ENST00000409087 1657 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 ZNF346-209ENST00000512315 1575 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 SCRN2-201ENST00000290216 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 GCOM1-201ENST00000380568 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 TMEM243-201ENST00000257637 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 CERCAM-201ENST00000372838 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
BATF3Q9NR55 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 PLEKHG4-205ENST00000450733 4480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 ASTN2-202ENST00000313400 4747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
BATF3Q9NR55 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms