Protein–RNA interactions for Protein: Q9NR23

GDF3, Growth/differentiation factor 3, humanhuman

Predictions only

Length 364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF3Q9NR23 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
GDF3Q9NR23 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 IKBIP-203ENST00000393042 1368 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 UBE2H-201ENST00000355621 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 RPS2P4-201ENST00000476944 856 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 TEPSIN-201ENST00000300714 2287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 AC079598.2-202ENST00000546624 1451 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 GPRC5C-204ENST00000392629 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 PTPMT1-202ENST00000326674 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 PDCD10-202ENST00000461494 934 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 ASB18-201ENST00000409749 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 TNIK-208ENST00000465393 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 PNMA6B-201ENST00000538162 1200 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 RPL17-204ENST00000579248 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 AC092368.3-202ENST00000574180 1591 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 AKAP17A-201ENST00000313871 3204 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 HLX-201ENST00000366903 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 NXN-202ENST00000537628 1340 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 RRNAD1-202ENST00000368218 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
GDF3Q9NR23 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.9 ms