Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPH3

IL1RAP, Interleukin-1 receptor accessory protein, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IL1RAPQ9NPH3 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC18■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 CERKL-203ENST00000374969 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 FAM66E-201ENST00000529252 1433 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 FAM66B-201ENST00000529456 1432 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 COMP-202ENST00000425807 2292 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 FEZ1-205ENST00000524435 750 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 SIRT3-202ENST00000524564 1395 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 AC008060.1-201ENST00000401499 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 C16orf59-210ENST00000569496 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 CALM3-202ENST00000391918 702 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 WIPF1-205ENST00000409415 1772 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 PADI2-201ENST00000375481 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 RAB34-203ENST00000395243 1597 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 GPRC5C-205ENST00000481232 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 PIP4K2A-202ENST00000376573 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 TOM1L2-210ENST00000542206 1320 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
IL1RAPQ9NPH3 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.6 ms