Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP90

RAB9B, Ras-related protein Rab-9B, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB9BQ9NP90 CELF6-205ENST00000567083 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 ARHGAP22-204ENST00000417247 2340 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 RFC2-202ENST00000352131 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 C10orf76-201ENST00000311122 724 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 SLC47A1P1-201ENST00000420951 500 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 PNN-205ENST00000556530 601 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 INO80E-214ENST00000620599 515 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 SUSD1-202ENST00000374263 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 PGAM5-203ENST00000498926 2834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 ANTXR1-203ENST00000409829 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 PAOX-201ENST00000278060 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
RAB9BQ9NP90 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 STX18-201ENST00000306200 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 HOXA6-201ENST00000222728 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 DMKN-207ENST00000419602 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 ANKRD18DP-204ENST00000455355 1975 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 HCK-207ENST00000520553 2101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 NAAA-206ENST00000507956 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 MRPS24-201ENST00000317534 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 EGFL7-202ENST00000371698 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
RAB9BQ9NP90 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms