Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0E8

LNPK, Protein lunapark, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LNPKQ9C0E8 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 GRK6-201ENST00000355472 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 DUSP1-201ENST00000239223 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 AC073912.1-201ENST00000546264 587 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 LMNB1-202ENST00000395354 1572 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 MIB2-231ENST00000518681 3116 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
LNPKQ9C0E8 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 SDCBP-204ENST00000447182 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
LNPKQ9C0E8 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms