Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0C4

SEMA4C, Semaphorin-4C, humanhuman

Predictions only

Length 833 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4CQ9C0C4 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 C17orf58-201ENST00000334461 1535 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 ZNF852-201ENST00000436261 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 ASCL5-201ENST00000449188 2026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 GPR50-AS1-201ENST00000454196 1620 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 MCRIP1-201ENST00000455127 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 AC007161.3-201ENST00000469183 637 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 SYT7-208ENST00000542670 1887 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 LPAR2-203ENST00000586703 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 NTMT1-210ENST00000613644 1501 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 MAF1-201ENST00000322428 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 AC007731.5-201ENST00000429594 644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 PTPN11-202ENST00000392597 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 MOK-225ENST00000522867 1883 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 BRSK2-215ENST00000544817 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 SHKBP1-225ENST00000600733 2284 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 C19orf25-206ENST00000588849 1472 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 NTRK3-206ENST00000540489 2145 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 RTBDN-207ENST00000589272 2076 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 AF186192.2-201ENST00000524514 423 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 TMEM8A-201ENST00000250930 2346 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 GALNT16-204ENST00000553669 1629 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 RABEPK-204ENST00000394125 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 AC099778.1-201ENST00000568593 1911 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 LSM4-203ENST00000593829 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 KRT83-201ENST00000293670 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 TMEM218-213ENST00000531909 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
SEMA4CQ9C0C4 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms