Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL3

SMIM3, Small integral membrane protein 3, humanhuman

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Length 60 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM3Q9BZL3 PNKP-215ENST00000600910 1600 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 RGS3-232ENST00000620489 1503 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 CYB561-204ENST00000448884 1496 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 FAM71E1-204ENST00000600100 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 FUZ-201ENST00000313777 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 MAP7-209ENST00000618822 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 CORO1A-216ENST00000570045 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 GOSR2-226ENST00000639287 2367 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SMIM3Q9BZL3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
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