Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 MORN1-202ENST00000378529 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 CARD9-201ENST00000371732 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 LRRC42-203ENST00000371370 2037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 C4orf48-202ENST00000409860 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 FAM83E-201ENST00000263266 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 RAD23A-203ENST00000586534 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 HSD11B1L-204ENST00000411793 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 ESR1-210ENST00000456483 1368 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 P2RY6-210ENST00000542092 1674 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 AL162412.1-201ENST00000567129 965 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 TSEN15-203ENST00000423085 1743 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 ACY1-207ENST00000476854 1319 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 EPS8L2-230ENST00000610855 1633 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 ANKRD13D-216ENST00000514166 2138 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 ODF3B-201ENST00000329363 970 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 OR2A1-AS1-201ENST00000462305 773 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 AC004889.1-204ENST00000474656 773 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 CENPS-CORT-204ENST00000602296 1326 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 PLLP-201ENST00000219207 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
TRIM55Q9BYV6 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms